简介

16S rDNA为编码原核、真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列，16S rDNA因其序列在物种间的高度多样性，成为细菌分类学研究的“分子钟”，其序列包含可变区和保守区，可变区因细菌而异，且变异程度与细菌的系统发育密切相关。16S rDNA测序是通过提取微生物菌群的DNA，选择可变区的特定区段进行PCR扩增，再结合高通量测序分析，帮助研究人员大规模鉴定细菌群落组成，表达丰度，以及开展系统进化分析，促进对微生物群落与环境互作，以及与人类互作的研究。

项目优势

• 过程简单、易操作：环境样品（微生物群落）的最优解决方案，完全摆脱繁杂的菌株分离工作；
• 准确性高：从碱基保守水平测定，真实反映物种情况；
• 更为高效：与传统的研究方法相比，具有通量大、产出数据多等优点；
• 灵活：提供多种可满足16S/18S/ITS不同高变区域的研究需求。
• 与QIAGEN合作，对各种疑难样本和痕量样本核酸纯化具有丰富经验，确保后续实验顺利进行。

技术路线

• 微生物DNA提取
• DNA质检
• PCR扩增
• 扩增子文库制备及质检
• 上机
• 生物信息学分析

数据分析

服务周期

45天

结果展示

根据16s测序结果，计算并统计每个属细菌的丰富并进行比较，进而比较不同样本间微生物种属差异及丰度差异（参考文献doi:10.3390/ijms18010109）

聚类分析：最大似然法聚类分析微生物遗传进化关系（doi: 10.3389/fmicb.2016.02081.）