CRISPR全基因组筛选

  1. 简介

CRISPR/Cas9技术是近几十年来最强大的生物学技术突破之一,现已发展成为基因组编辑的热门工具。GeCKO v2文库最初是由Broad研究所张峰课题组设计而成(1)。该系统包含122411个和130209个分别特异性靶向人源和鼠源基因组的sgRNA文库，分别靶向于19050个和20611个人源和鼠源基因。适用于细胞生长重要调节因子，肿瘤细胞增殖关键基因，药敏性关键基因，细胞对致死致病原敏感性关键基因的高通量功能性筛选(2, 3)。

  1. 文库信息

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  1. 文库质控

gRNA覆盖度达到100%，丰度分布主要位于800-3000 reads区间，分布均一

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  1. 文库应用

(1) 使用人源GeCKO v2文库在黑色素瘤细胞中进行全基因组规模敲减实验从而实现药靶增敏基因的筛选

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(2) 鼠源GeCKO v2文库的非小细胞肺癌小鼠模型来源的细胞移植到小鼠体内从而进行肿瘤关键增值基因的筛选

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  1. 参考文献
  • Shalem O, et al. (2014) Science 343(6166):84-87.
  • Koike-Yusa H, et al. (2014) Nat Biotechnol 32(3):267-273.
  • Yau EH, et al. (2017) Cancer Res 77(22):6330-6339.
  • Ophir Shalem NES, et al. (2014) Science 343(6166):84-87.
  • Chen S, et al. (2015) Cell 160(6):1246-1260.
  1. 文库产品

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