宏基因组测序

简介

宏基因组de novo测序是指对环境样品中所有微生物基因组DNA片段化后进行高通量测序，进行序列组装和基因注释，获得部分不可纯培养微生物的基因组序列，分析该环境下所有微生物基因集信息。通过宏基因组de novo测序，能够解释微生物群落多样性、种群结构、进化关系、功能活性及环境之间的相互协作关系，极大地扩展了微生物学研究范畴。

项目优势

  • 拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台，实验周期短，质量可靠。
  • 拥有 Illumina HiSeq 2500 和 HiSeq 4000 等多种高通量测序平台。
  • 与QIAGEN合作，对各种疑难样本和痕量样本核酸纯化具有丰富经验，确保后续实验顺利进行。
  • 技术人员经验丰富，可以根据合作伙伴要求提供宏基因组、多组学实验方案、解决实验问题、分析实验结果。
  • 拥有专业的生物信息团队和大型计算机，可以为合作伙伴提供个性化的生物信息分析服务。

技术路线

  • 环境DNA样品抽提
  • DNA片段化
  • DNA片段末端修复
  • 3’端加A碱基
  • 加测序接头
  • PCR扩增
  • 文库检测
  • 上机测序
  • 生物信息学分析

数据分析

Metagenomic Seq svc image01
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服务周期

45-85天

结果展示

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An example of an output of a metagenomics approach of a faecal sample

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健康相关微生物核心代谢途径KEGG分析（DOI: 10.1038/srep38993）

Metagenomic Seq svc image05

Bland-Altman图分析健康人与牙周炎患者差异微生物分析（DOI: 10.1038/srep38993）